La historia institucional de la Gobernación de Oruro se resume en su evolución de una entidad controlada por el gobierno central a una institución totalmente autónoma:
- Época de la Prefectura (1826 – 2009): Nació con la creación del departamento bajo el nombre de Prefectura. Durante casi dos siglos, el poder estuvo centralizado: el Prefecto no era elegido por los orureños, sino que lo nombraba directamente el Presidente de Bolivia para hacer cumplir las órdenes del gobierno nacional.
- Primer paso democrático (2005): Por primera vez en la historia, el pueblo orureño acudió a las urnas para elegir a su propio Prefecto mediante el voto popular, rompiendo con la designación directa desde La Paz.
- Transición a la Gobernación (2010): Tras la aprobación de la nueva Constitución, la Prefectura desapareció oficialmente para dar nacimiento al Gobierno Autónomo Departamental de Oruro (Gobernación). El ejecutivo pasó a llamarse Gobernador y se creó la Asamblea Legislativa Departamental para redactar sus propias leyes regionales.
- Actualidad (2026): Consolidando su carácter autónomo, la institución es liderada hoy por el Ing. Edgar Sánchez Aguirre, elegido democráticamente en los comicios subnacionales de 2026 para administrar de manera directa el presupuesto, las obras viales y el desarrollo productivo del departamento.